1. Microfluidique pour la biologie
Notre laboratoire L2 BioMicrofluidique est un laboratoire biologique dédié à l’expérimentation confinée d’agents biologiques classés en groupe 2 (règlement français du 16/07/2007) et d’organismes génétiquement modifiés (OGM) à confiner dans un laboratoire de niveau 2 (Manuel HCB, 30/11/2014). Celui-ci offre tous les équipements nécessaires à la biologie cellulaire (PSM de type II, microscope de contrôle, compteur automatique de cellules, enceintes CO2…). On trouve également dans cet espace, des plans de travail dotés de systèmes d’actuation fluidique : pousse-seringue (Nemesys, Harvard), contrôleur en pression (positif/négatif Push-Pull fluigent), ordinateurs de contrôle, mesureurs de débit … pour l’étude en flux des micro-dispositifs. Sur chacune de ces zones de travail, un incubateur CO2 est mis à disposition pour permettre la culture cellulaire en microsystème.
Le pôle s’est doté d’une Bioimprimante 3D. Grâce à la technique de Bioimpression 3D, des cellules et des biomatériaux peuvent être déposés couche par couche pour créer des structures cellulaires ayant des propriétés proches des tissus naturels.
2. Microscopie pour la biologie
Cet espace propose aussi une pièce de microscopie comportant 3 microscopes.
Le premier microscope est un Leica DMi8 doté d’une platine motorisée X, Y et Z. Il permet de faire des times laps longue durée grâce au système de maintien de focus adaptif et de sa chambre environnementée (contrôle de la température et de la concentration en CO2). Ce microscope est particulièrement adapté au suivi en temps réel de cellules en microsystème fluidique. Un système de photopatterning (Primo d’Alvéole) est également installé sur le Leica DMi8. Celui-ci permet de faire du micropatterning de protéines et de générer en quelques secondes n’importe quel motif avec plusieurs protéines sur des supports de culture cellulaire classiques.
Un second microscope Echo Revolution de la marque BiCo Company est un microscope breveté permettant de basculer d’une configuration droite à inversée en quelques secondes seulement en basculant simplement le corps du microscope. Ceci est particulièrement intéressant pour la microscopie inversée (pour les échantillons en cellules vivantes en format multi-puits, en flasks, en boite de petri…) mais également pour la microscopie droite (pour les échantillons fixés notamment). Il est muni d’une chambre environnementée pour le suivi en temps réel d’expérience en cellules vivantes. Il permet également de réaliser des expériences de time-lapse, en stitching, en multi-canaux et en 3D.
Un troisième microscope est un confocal benchtop BC43 de la marque Andor. Celui-ci permet de réaliser de la microscopie à fluorescence, en lumière transmise, de l’imagerie confocale et en super-résolution. Le logiciel d’introduction Imaris installé sur le poste du microsocpe permet de visualiser les stacks d’images en 2D/3D et 4D images. Ce logiciel permet de créer des snapshots en haute résolution et des films en multi-dimensions. Ce microscope est lui aussi équipée d’une chambre environnementée.
3. Biologie moléculaire
La plateforme de biologie moléculaire est équipée d’outils permettant la quantification des acides nucléiques/protéines
Implen™ NanoPhotometer™ NP80
L’Implen™ NanoPhotometer™ NP80 est un spectrophotomètre compact et intuitif, idéal pour la quantification de l’ADN, de l’ARN et des protéines. Il offre une mesure précise sur une plage de mesure étendue, sans oublier sa capacité à mesurer des volumes aussi faibles que 0,3 µL.
CFX Opus Real-Time PCR System
Le système CFX Opus Real-Time PCR est une plateforme de PCR quantitative (qPCR) de haute performance, conçue pour des applications en recherche et en diagnostic. Ce thermocycleur en temps réel est équipé d’une optique qui offre une détection multiplexée, précise et rapide de 5 signaux fluorescents, assurant une quantification fiable des acides nucléiques. Le logiciel CFX Maestro permet une analyse complète des données, facilitant ainsi l’interprétation des résultats.
Système d’électrophorèse
Le laboratoire dispose également d’un système d’électrophorèse pour la séparation et l’analyse des acides nucléiques et des protéines. Ce système est composé de plusieurs unités, incluant des cuves d’électrophorèse horizontale pour l’analyse des fragments d’ADN par électrophorèse sur gel d’agarose et des cuves verticales pour la séparation des protéines par électrophorèse sur gel de polyacrylamide (SDS-PAGE). Les équipements sont complétés par des transilluminateurs UV et des systèmes de documentation par imagerie numérique, permettant la visualisation et la quantification des bandes d’ADN ou de protéines marquées.
