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ACTUALITES

Offre d‘emploi: Ingénieur de recherche pour la fabrication de dispositif multiélectrodes (MEA) transparentes pour l’analyse multimodale de réseaux de neurones (H/F)

Missions Le projet SpaiCon est financé par la fondation Novo Nordisk via le programme « Exploratory Interdisciplinary Synergy 2021». Dans ce projet de recherche international (entre le Danemark, les USA et la France) et interdisciplinaire (biologie, bioélectronique, microfabrication et sciences computationnelles), nous proposons le développement d’une nouvelle technologie appelée « SPAtIal CONnectomics (SpaiCon) », capable de traiter des informations cellulaires complexes. Le but principal est de combiner la plateforme d’hybridation in situ par fluorescence multiplexée et robuste aux erreurs (MERFISH), pour le profilage transcriptomique spatial, avec des réseaux de multiélectrodes pour mesurer l’activité électrophysiologique de neurones. MERFISH caractérise l’expression des gènes dans les cellules individuelles à l’aide de sondes fluorescentes et permet la localisation spatiale des transcrits ARNm exprimés. Les réseaux de multiélectrodes (MEA) peuvent enregistrer, quant à eux, l’activité électrique et/ou stimuler les cellules au niveau de sites spécifiques au sein d’une coupe de tissu ou d’un réseau de neurones en 2D. Grâce à nos diverses expertises dans les domaines de la microélectronique, des neurosciences et de la bioinformatique, nous avons pour ambition de créer une nouvelle plateforme d’analyse multi-omics qui permettra d’étudier des dynamiques biologiques spatio-temporelles. Le projet implique la fabrication et l’évaluation de réseaux de multi-électrodes transparentes en PEDOT:PSS compatibles avec la technologie MERFISH. Les résultats issus du projet SpaiCon auront un fort impact sur les neurosciences, mais également sur la cardiologie et d’autres domaines de la biologie, car il permettra une caractérisation multimodale sans précédent des tissus considérés. En particulier, il ouvrira de nouvelles voies de compréhension de l’expression des gènes influençant l’activité électrophysiologique et vice versa. SpaiCon intéressera à la fois les chercheurs qui étudient la biologie fondamentale, la régénération et la vascularisation des tissus ainsi que ceux s’intéressant aux approches translationnelles en développant de nouvelles thérapies pour les maladies neurodégénératives, cardiovasculaires et musculaires..
Activités
  • Dans le cadre du projet SpaiCon, nous recherchons un ingénieur de recherche (IR) talentueux qui travaillera au développement technologique des puces SpaiCon et de leur validation dans le cadre de mesures d’électrophysiologie via un système MCS combinées au microscope à fluorescence utilisé dans la technique MERFISH. Plus précisément, l’ingénieur de recherche recruté sera chargé de la conception, du design et de la fabrication des réseaux de multiélectrodes transparentes en tenant compte de plusieurs paramètres :
    i) Augmenter la surface disponible pour l’imagerie,
    ii) Augmenter la transparence, en remplaçant les pistes de contact en or par des pistes transparentes en PEDOT:PSS,
    iii) Insérer une chambre amovible permettant d’utiliser la puce en imagerie de fluorescence inversée.
    iv) Adapter l’emplacement des électrodes pour l’imagerie MERFISH.
    v) Produire des puces tout-polymère jetables et bon marché en remplaçant le verre par du PMMA (plexiglas) ou des alternatives similaires tout en gardant de bonnes propriétés optiques. Cette dernière solution réduira considérablement les coûts et simplifiera leur fabrication, permettant ainsi d’augmenter les volumes de production (production d’environ 12 puces tous les 3 mois). En outre, l’utilisation de puces entièrement en polymère facilitera l’expédition vers nos partenaires.
  • Si nécessaire, une fonctionnalisation de surface pourrait être réalisée pour améliorer la croissance cellulaire ou pour maintenir les tranches de cerveau en place en ajustant la mouillabilité de la surface ou en introduisant des fonctions chimiques spécifiques. Toutes les caractérisations physiques (impédance électrique et transparence) seront effectuées en mettant l’accent sur la réduction des variations d’un lot à l’autre, ce qui est crucial pour valider les hypothèses biologiques.
    Il ou elle mènera de manière autonome un ensemble de travaux de recherche interdisciplinaires allant du développement technologique des MEA à leurs caractérisations électrique et physique, en passant par leur fonctionnalisation et leur co-intégration. Bien que l’activité principale soit centrée sur le développement de dispositifs dans un environnement de salle blanche avec caractérisation physique/chimique, l’ingénieur devra être capable d’interagir avec d’autres collègues experts en biologie, biochimie et chimie le tout dans un contexte international. Notamment, la visite des partenaires internationaux (États-Unis et Danemark) sera envisagée pour l’adaptation des protocoles MERFISH/Multielectrode array.
Compétences
  • Le candidat devra être titulaire d’un doctorat dans l’une des disciplines mentionnées ci-dessous et nécessaires à la bonne réalisation du projet : dispositifs/électronique et/ou sciences des matériaux et/ou électrochimie et/ou micro/nanofabrication. Toutes ces compétences sont requises pour le poste. En outre, des compétences en biologie et/ou en biochimie seront un grand plus. D’une manière générale, le candidat devra avoir de bonnes connaissances académiques et un intérêt personnel pour la recherche interdisciplinaire.
Contexte de travail : Le projet se déroulera au sein de l’Institut d’électronique, de microélectronique et de nanotechnologie (IEMN) situé à Villeneuve d’Ascq (Hauts de France). L’IEMN est un institut de recherche créé par le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), deux universités et une école d’ingénieurs de la région Nord. Les équipements de l’IEMN tant au niveau de la conception, de la fabrication et de la caractérisation de micro/nano dispositifs sont au meilleur niveau européen. L’effectif total de l’institut est d’environ 500 personnes dont 109 professeurs et professeurs associés, 45 chercheurs du CNRS, 100 ingénieurs et agents administratifs, environ 150 doctorants ainsi que 30 post doc et professeurs invités. Le laboratoire est très ouvert aux collaborations internationales avec plus de 100 scientifiques étrangers venant de 20 pays différents travaillent actuellement à l’IEMN. L’activité scientifique de l’IEMN couvre un large domaine allant de la physique des matériaux et des nanostructures aux micro-ondes, aux télécommunications et à l’instrumentation acoustique.
Contraintes et risques Rien de particulier. Formations prodiguées pour les différents équipements des plateformes ainsi qu’une formation sécurité dédiée aux risques physiques, chimiques et biologiques. Accès à une ZRR.


Unité d’accueil :
IEMN UMR CNRS 8520
Avenue Poincaré
59652 VILLENEUVE D ASCQ CEDEX
www.iemn.fr

Référence :
UMR8520-YANCOF-011

Type de contrat :
CDD Technique/Administratif

Durée du contrat :
30 mois

Date d’embauche:
21 mars 2022

Quotité de travail :
Temps complet

Rémunération :
A partir de 2690 euros bruts selon expérience

Niveau d’études:
Doctorat

Expérience souhaitée :
1 à 4 années

Pour plus d’informations:
yannick.coffinier@univ-lille.fr

Pour postuler, s’inscrire sur le site du CNRS

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