Résumé :
En quelques années, l’étude du microbiote intestinal et de son incidence sur la santé humaine est devenue un domaine de recherche majeur. Cette vaste communauté microbienne, hébergée dans l’intestin, exerce de nombreuses fonctions biologiques et métaboliques et confère de nombreux avantages à l’hôte. Ces dernières années, des déséquilibres entre différentes populations bactériennes intestinales, ou dysbioses, ont été décrits dans diverses pathologies et désordres métaboliques chez l’homme, soulignant l’importance du microbiote intestinal vis-à-vis de la santé humaine
Depuis plusieurs années, notre équipe s’intéresse aux interactions entre le microbiote commensal et la physio-pathologie digestive, en ciblant en particulier les cellules épithéliales intestinales. Nous avons montré, que des bactéries primocolonisatrices, en particulier une souche commensale d’Escherichia coli, joue un rôle prépondérant sur la maturation et le remodelage de l’épithélium colique lors des premières expositions aux bactéries. Ce remodelage conduit au développement de cryptes plus profondes, à un équilibre dynamique entre les différentes lignées cellulaires étudiées et à la mise en place des mécanismes de défense innée (sécrétion de mucus, mouvements ioniques). Les données obtenues sur modèles mono-associés montrent une réponse transcriptionnnelle dynamique de l’iléon et du côlon aux souches commensales d’E coli qui touche l’expression de gènes clé dans l’homéostasie intestinale. Ces effets s’accompagnent d’un effet bénéfique dans un modèle murin de prédisposition à développer une inflammation intestinale.
L’ensemble de nos données représentent des apports significatifs dans la compréhension des relations entre microbiote et cellules intestinales. Nous développons maintenant des travaux pour étudier 1/l’impact de l’alimentation (régime riche en graisse, prébiotiques) dans la modulation de ces interactions et 2/ les mécanismes mis en jeu, en particulier par l’apport des organoïdes intestinaux.
Bibliographie
• Cherbuy C. et al. A resistant-starch containing dietary supplement remodels the caecal gut microbiota composition and increase caecal butyrate concentration in a model of gut microbiota associated mice, in a donor dependant manner. Frontiers in microbiology (positive revision).
• Escribano-Vazquez U et al. The commensal Escherichia coli strain CEC15 reinforces intestinal defence mechanisms in gnotobiotic mice and is protective in a chronic colitis mouse model. Soumis à Scientific report (positive revision).
• Mathieu E et al. Paradigms of Lung Microbiota Functions in Health and Disease, Particularly, in Asthma. Front Physiol. 2018 Aug 21;9:1168.
• Cherbuy C et al. The Contribution of Intestinal Gluconeogenesis to Glucose Homeostasis Is Low in 2-Day-Old Pigs. J Nutr. 2017 Mar;147(3):361-366.
• Tomas J et al. Early colonizing Escherichia coli elicits remodeling of rat colonic epithelium shifting toward a new homeostatic state. ISME J 2015;9(1):46-58. doi: 10.1038/ismej.2014.111.
• Tomas J et al. Primo-colonization is associated with colonic epithelial maturation during the conventionalization process. FASEB J. 2013 Feb;27(2):645-55